شناسایی مولکولی و ارزیابی ژنتیکی ماهی شیر Scomberomorus commerson بر اساس D-Loop ژنوم میتوکندریایی در خلیج‌فارس، دریای عمان و دریای عرب با استفاده از تکنیک High Resolution Melting Real Time PCR
نویسندگان
چکیده مقاله:
ماهی شیر(Scomberomorus commerson) از خانواده تون ماهیان (Scomberidae) بوده و ازنظر اقتصادی و اکولوژیکی دارای اهمیت زیادی می‌باشد. در این بررسی شناسایی مولکولی و تمایز ژنتیکی این ماهی بر اساس منطقه D-loop ژنوم میتوکندریایی با استفاده از تکنیک HRM-Real Time PCR صورت پذیرفته است. برای این کار، باله پشتی 100 نمونه ماهی شیراز 4 منطقه بوشهر، دوحه، جاسک و کراچی تهیه و پس از استخراج ژنوم آن‌ها با انجام واکنش HRM-Real Time PCR با استفاده از رنگ SYTO 9، گروه‌بندی صورت پذیرفت. سرگروه‌ها برای آبهای بوشهر در 8 گروه، دوحه 6 گروه، جاسک 9 گروه و کراچی 6 گروه دسته‌بندی شدند و درنهایت پس از بررسی نمونه‌ها، در واکنش نهایی HRM-Real Time PCR، 20 گروه حاصل شد. نمونه‌های منتخب با انجام مجدد واکنش زنجیره‌ای پلیمر از برای تعیین توالی ارسال شدند. نتایج به‌دست‌آمده از تعیین توالی با توالی‌های موجود در بانک ژنی NCBI مقایسه شده و جنس و گونه ماهی شیر S. commerson شناسایی شد. سپس با رسم درخت فیلوژنی توسط توالی‌های به‌دست‌آمده و مشاهده تمایز ژنتیکی، مشخص شد که این تکنیک می‌تواند به‌عنوان یک تکنیک مؤثر در تفکیک و گروه‌بندی نمونه‌ها برای بررسی‌های جمعیتی و سرعت بخشیدن به روند تحقیق مورداستفاده قرار گیرد.
منابع مشابه
شناسایی مولکولی و ارزیابی ژنتیکی ماهی شیر scomberomorus commerson بر اساس d-loop ژنوم میتوکندریایی در خلیج فارس، دریای عمان و دریای عرب با استفاده از تکنیک high resolution melting real time pcr
ماهی شیر(scomberomorus commerson) از خانواده تون ماهیان (scomberidae) بوده و ازنظر اقتصادی و اکولوژیکی دارای اهمیت زیادی می باشد. در این بررسی شناسایی مولکولی و تمایز ژنتیکی این ماهی بر اساس منطقه d-loop ژنوم میتوکندریایی با استفاده از تکنیک hrm-real time pcr صورت پذیرفته است. برای این کار، باله پشتی 100 نمونه ماهی شیراز 4 منطقه بوشهر، دوحه، جاسک و کراچی تهیه و پس از استخراج ژنوم آن ها با انجام...
متن کاملتنوع و تمایز ژنتیکی ماهی شیر (Scomberomorus commerson) در سواحل شمالی خلیج فارس و دریای عمان با روش مولکولی ریزماهواره
هدف مطالعه حاضر، بررسی ساختار ژنتیکی ماهی شیر Scomberomorus commerson، در خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از جایگاه های ریزماهواره بود. 90 نمونه ماهی شیر بالغ، در مجموع از سه منطقه کنارک و پسابندر در استان سیستان و بلوچستان، بندرعباس در استان هرمزگان و دیر در استان بوشهر، جمع آوری شد. پنج جفت پرایمر ریزماهواره (C83Sc، H96Sc ، J43Sc ، F6Sc و L42Sc) برای تع...
متن کاملتنوع و تمایز ژنتیکی ماهی شیر (scomberomorus commerson) در سواحل شمالی خلیج فارس و دریای عمان با روش مولکولی ریزماهواره
هدف مطالعه حاضر، بررسی ساختار ژنتیکی ماهی شیر scomberomorus commerson ، در خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از جایگاه های ریزماهواره بود. 90 نمونه ماهی شیر بالغ، در مجموع از سه منطقه کنارک و پسابندر در استان سیستان و بلوچستان، بندرعباس در استان هرمزگان و دیر در استان بوشهر، جمع آوری شد. پنج جفت پرایمر ریزماهواره (c83sc، h96sc ، j43sc ، f6sc و l42sc) برای تعیین تمایز ژنتیکی استفاده گردید. بر اس...
متن کاملبررسی پلی‌مورفیسم ژنوم میتوکندریایی ماهی سوکلا Rachycentron canadum در آبهای شمالی خلیج فارس و دریای عمان
سابقه و هدف: به دلیل ارزش غذایی ماهی سوکلا و اهمیت آن از نظر رشد سریع در شرایط پرورشی و ارزش تجاری قابل توجه و نیز فقدان پیشینه مطالعاتی کافی، در این پژوهش پلی‌مورفیسم ژنومی این گونه در آبهای جنوبی کشور در سال 1389 بررسی گردید تا تنوع ژنتیکی و میزان آن در درون و مابین جمعیتهای احتمالی مشخص گردد. مواد و روشها: تحقیق به روش Cross sectional و بر روی 120 نمونه ماهی سوکلا انجام گردید که از آبهای چها...
متن کاملتجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندریایی در بوقلمون بومی خراسان
هدف از این مطالعه، تجزیه ژنتیکی و فیلوژنتیک ناحیه D-LOOP ژنوم میتوکندری بوقلمون بومی خراسان بود. بدین منظور، از 20 قطعه بوقلمون بومی خراسان نمونه خون جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA، تکثیر قطعه 850 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. تعداد 10 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 5 نوکلئوتید چند شکل موجو...
متن کاملمطالعه ساختار ژنتیکی پایکای افغانی (Ochotona rufescens) با استفاده از توالی ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندریایی در خراسان شمالی
در پژوهش حاضر، با استفاده از ناحیه D-Loop میتوکندریایی، تنوع ژنتیکی پایکای افغانی (Ochotona rufescens) در بین چهار جمعیت مختلف در استان خراسان شمالی بررسی و تحلیل شد. به این منظور، تعداد 16 فرد (4 فرد از هر جمعیت) از چهار منطقه حفاظت شده (قرخود، گلول-سرانی، سالوک و ساریگل) جمع‌آوری و پژوهش‌های آزمایشگاهی انجام شد. عوامل ژنتیکی بین و درون جمعیتهای پایکا از قبیل تنوع ژنتیکی و نوکلئوتیدی، تفاوت ه...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 8 شماره 2
صفحات 63- 72
تاریخ انتشار 2016-08
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023